Główną bohaterką powieści jest Mary, rozkapryszona dziewczynka, która po śmierci rodziców nie jest w stanie odnaleźć się w angielskiej posiadłości niedostępnego wuja Cravena. Jej wewnętrzna przemiana rozpoczyna się od momentu odnalezienia furtki do zamkniętego od 10 lat Tajemniczego Ogrodu, miejsca pełnego zaniedbanych roślin i kwiatów, ale mimo pozornej śmierci, wciąż żyjącego. Wystarczy odrobina starań, aby ogród znów tętnił życiem i barwami.