Atlas chorób drzew owocowych zawiera podstawowe informacje o 52 chorobach infekcyjnych występujących w Polsce lub jeszcze u nas niewykrytych ale stanowiących zagrożenie dla rodzimych sadów. Poszczególnym gatunkom drzew owocowych przyporządkowano występujące na nich choroby - z zachowaniem kolejności alfabetycznej według ich nazw. Obok nazwy danej choroby w języku polskim podano jej odpowiednik w języku angielskim. Osobny rozdział poświęcono chorobom występującym na różnych gatunkach drzew owocowych. Opisy poszczególnych chorób składają się z następujących części: występowanie i szkodliwość, objawy, źródło infekcji i rozwój choroby, czynniki sprzyjające rozwojowi choroby, terminy i sposób monitorowania oraz ochrona. Opisy wzbogaca dokumentacja fotograficzna przedstawiająca najważniejsze objawy danej choroby. W części dotyczącej ochrony nie zamieszczono wykazu wykorzystywanych w niej środków chemicznych, ponieważ ich asortyment często się zmienia. Niemal rokrocznie wygasa zezwolenie na stosowanie niektórych spośród nich, a rejestrowane są nowe. Tam, gdzie było to możliwe, podaliśmy jedynie grupy stosowanych środków chemicznych. Również szczegółowe programy ochrony podlegają różnym modyfikacjom i aktualizacji, co jest związane m.in. z wynikami prowadzonych badań.